Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG4Q9H9E3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms