Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCL3Q9H2J4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCL3Q9H2J4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms