Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH19Q9H159 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH19Q9H159 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH19Q9H159 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms