Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80BQ9C086 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms