Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1BQ9BZX4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms