Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRXQ9BXM0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRXQ9BXM0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRXQ9BXM0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRXQ9BXM0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRXQ9BXM0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRXQ9BXM0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PRXQ9BXM0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRXQ9BXM0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRXQ9BXM0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRXQ9BXM0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRXQ9BXM0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms