Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R3Q9BXE9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R3Q9BXE9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms