Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
REPIN1Q9BWE0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms