Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFC1Q9BW19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFC1Q9BW19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms