Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN3Q9BTN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN3Q9BTN0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms