Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNPY3Q9BT09 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNPY3Q9BT09 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms