Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms