Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms