Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms