Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC77Q9BR77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms