Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms