Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TREX2Q9BQ50 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms