Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RBM4BQ9BQ04 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBM4BQ9BQ04 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms