Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP1Q9BPW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms