Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL4Q9BPW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL4Q9BPW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms