Protein–RNA interactions for Protein: Q99726

SLC30A3, Zinc transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A3Q99726 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC30A3Q99726 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC30A3Q99726 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC30A3Q99726 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC30A3Q99726 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC30A3Q99726 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC30A3Q99726 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC30A3Q99726 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms