Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP19Q99542 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms