Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLCC1Q96S66 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLCC1Q96S66 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms