Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms