Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARXQ96QS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARXQ96QS3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms