Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A2Q96QD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms