Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CR12Q96Q35 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CR12Q96Q35 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CR12Q96Q35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms