Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms