Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD27Q96NW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD27Q96NW4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD27Q96NW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms