Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF641Q96N77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF641Q96N77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF641Q96N77 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms