Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP57Q96MR6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP57Q96MR6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms