Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDLIM2Q96JY6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDLIM2Q96JY6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms