Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MAGED4Q96JG8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAGED4Q96JG8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms