Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EAF1Q96JC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms