Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP3Q96JB5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms