Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LTV1Q96GA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LTV1Q96GA3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms