Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHFRQ96EP1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHFRQ96EP1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms