Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FBXO17Q96EF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO17Q96EF6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms