Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EAF2Q96CJ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EAF2Q96CJ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EAF2Q96CJ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms