Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6Q969F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C6Q969F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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