Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP2A3Q93084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms