Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRF1Q92994 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms