Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GATA6Q92908 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATA6Q92908 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms