Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD50Q92878 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms