Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGGTAQ92696 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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