Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX1Q92499 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX1Q92499 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms