Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIRE2Q8WWL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIRE2Q8WWL2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms