Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSKUQ8WUA8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSKUQ8WUA8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms