Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF2Q8TEC5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms