Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms